【科研工作】
致力于吸收借鉴西方社会科学前沿成果，发展适合中国国情的制度分析与公共管理理论和方法，探索中国公共管理和政策问题的解决之道。主持完成各类基金课题、国家部委委托和国际合作课题20余项，包括国家自然科学基金项目2项，国家社会科学基金项目1项，国家重大科技水专项子课题1项，水利部委托课题5项。在水政策与管理方向开展了大量交叉研究工作，研究成果产生了一定的学术影响和政策影响。
已在《管理世界》、《世界经济与政治》、《经济研究》、《经济学（季刊）》、《经济社会体制比较》、《中国软科学》、《中国人口l资源与环境》等中文学术期刊和Water Resources Management、Agricultural Water Management、International Journal of Water Resources Development、Water Policy、China & World Economy等英文学术期刊发表论文百余篇。出版个人专著与合著8部，参与中英文著作10余部。另在《国情报告》、《改革内参》、《经济要参》等高级内参发表研究报告50余篇，多份成果获领导批示或应用采纳。

【代表性著作】
1. Wang Yahua. Structure and Change in China's Water Rights. Springer Nature, 2017年。
2. 王亚华，《增进公共事物治理——奥斯特罗姆学术探微与应用》，清华大学出版社，2016年。
3. 王亚华，《中国水利发展阶段研究》，清华大学出版社，2013年。
4. 王亚华，《中国水治道变革》，清华大学出版社，2013年。
5. 王亚华，《水权解释》，上海三联书店、上海人民出版社，2005年。
6. 胡鞍钢、王亚华，《国情与发展》，清华大学出版社，2005年。

【代表性论文】
1. Yahua Wang, Chunliang Chen, Eduardo Araral. The Effects of Migration on Collective Action in the Commons: Evidence from Rural China, World Development, Vol. 88, 2016, pp. 79-93.
2. Yahua Wang, Maitreyee Mukherjee, Dan Wu, Xun Wu. Combating River Pollution in China and India: Policy Measures and Governance Challenges. Water Policy, 2016, DOI: 10.2166/wp.2016.008.
3. Eduardo Araral, Yahua Wang, Does Water Governance Matter to Water Sector Performance? Evidence from 10 Provinces in China, Water Policy, Vol. 17, No.2, 2015, pp.268-282.
4. Yahua Wang, Sicheng Chen, Breaking the Dilemma of Agricultural Water Fee Collection in China. Water Policy, Vol.16, 2014, pp.773-784.
5. Sicheng Chen, Yahua Wang, Tingju Zhu, Exploring China's Farmer-level Water-saving Mechanisms: Analysis of an Experiment Conducted in Taocheng District, Hebei Province. Water, No.6, 2014, pp.547-563.
6. Yahua Wang, Leong Ching, Institutional Legitimacy: An Exegesis of Normative Incentives. International Journal of Water Resources Development. Vol.29, No.4, 2013, pp.514-525.
7. Eduardo Araral, Yahua Wang, Water Governance 2.0: A Review and Second Generation Research Agenda. Water Resources Management. Vol.27, 2013, pp.3945-3957.
8. Eduardo Araral, Yahua Wang, Water Demand Management: Review of Literature and Comparison in South-East Asia. International Journal of Water Resources Development, Vol.29, 2013, pp.435-450.
9. Yahua Wang, A Simulation of Water Rights Market with Transaction Costs. Agriculture Water Management, Vol.103, 2012, pp.54-61.
10. Yahua Wang, Angang Hu, Multiple Forces Driving China’s Economic Development: A New Analytic Framework. China & World Economy, Vol. 15, No.3, 2007, pp.103-20.
11. 王亚华、高瑞、孟庆国：《中国农村公共事务治理的危机与响应》，《清华大学学报（哲学社会科学版）》，2016年第2期，第23-29页。
12. 高瑞、王亚华、陈春良：《劳动力外流与农村公共事务治理》，《中国人口？资源与环境》，2016年第2期，第84-92页。
13. 王亚华、陶椰、康静宁：《知识产权强国建设的现实国情研究》，《知识产权》，2015年第12期，第17-23页。
14. 王亚华、温胜芳、王晓莉：《中国农村水情意识调查》，《中国农村水利水电》，2015年第12期：第78-81页。
15. 王亚华、汪训佑：《中国渠系灌溉管理绩效及其影响因素》，《公共管理评论》，2014年第16卷，第47-68页。
16. 王亚华：《水治理如何“两手发力”》，《中国水利》，2014年第10期，4-6页。
17. 王亚华：《中国用水户协会改革：政策执行视角的审视》，《管理世界》，2013年第6期，第61-71页。
18. 王亚华、黄译萱、唐啸：《中国水利发展阶段划分:理论框架与评判》，《自然资源学报》，2013年第6期，第922-910页。
19. 王亚华、吴丹：《淮河流域水环境管理绩效动态评价》，《中国人口.资源与环境》，2012年第12期，第32-38页。
20. 王亚华、黄译萱：《中国水利现代化进程的评价和展望》，《中国人口.资源与环境》，2012年第6期，第120-127页。
21. 王亚华、胡鞍钢：《中国水利之路：回顾与展望（1949-2050）》，《清华大学学报（哲学社会科学版）》，2011年第5期，第99-112页。
22. 王亚华、胡鞍钢：《中国国情与水利现代化构想》，《中国水利》，2011年第6期，第132-135页。
23. 王亚华、田富强：《对黄河水权转换试点实践的评价和展望》，《中国水利》，2010年第1期，第21-25页。
24. 刘生龙、王亚华、胡鞍钢：《西部大开发成效与中国区域经济收敛》，《经济研究》，2009年第9期，第94-104页。
25. 王亚华、鄢一龙：《中国10个五年计划完成情况的定量评估》，《当代中国史研究》，2009年第5期，第77-84页。
26. 王亚华、吴凡、王争：《交通行业生产率变动的Bootstrap-Malmquist指数分析（1980—2005）》，《经济学（季刊）》，2008年第3期，第891-912页。
27. 王亚华：《治水与治国——治水派学说的新经济史学演绎》，《清华大学学报（哲学社会科学版）》，2007年第4期, 第117-129页。
28. 王亚华：《关于我国水价、水权和水市场改革的评论》，《中国人口.资源与环境》，2007年第5期，第153-158页。
29. 王亚华、胡鞍钢：《从五大资本比较看中国经济追赶美国》，《经济社会体制比较》，2007年第1期，第29-35页。
30. 王亚华、胡鞍钢：《从国际比较看中国发展态势：五大资本及总资本视角》，《世界经济与政治》，2006年第12期，第54-59页。
31. 王亚华：《自然资源产权科层理论及其应用》，《公共管理评论》，2006年第5卷，第128-136页。
32. 王亚华、张宁、施祖麟：《海河流域水生态环境破坏的经济损失估算》，《中国农村水利水电》，2006年第1期，第33-37页。
33. 胡鞍钢、王亚华：《中国国情分析框架：五大资本及动态变化（1980－2003）》，《管理世界》，2005年第11期，第4-11页。
34. 王亚华：《反坝，还是建坝？——国际反坝运动反思与我国公共政策调整》，《中国软科学》，2005年第8期，第33-39页。
35. 王亚华：《我国建设节水型社会的框架、途径和机制》，《中国水利》，2003年第10期，第15-18页。
36. 胡鞍钢、王亚华：《如何看待黄河断流与流域水治理——黄河水利委员会调研报告》，《管理世界》，2002年第7期, 第29-34页。
37. 王亚华、胡鞍钢：《黄河流域治理模式应从控制转向良治》，《人民黄河》，2002年第1期，第23-25页。
38. 胡鞍钢、王亚华：《转型期水资源配置的公共政策：准市场和政治民主协商》，《中国软科学》，2000年第5期，第5-11页。

【部分科研项目】
1. 国家社会科学基金重大项目：“中国特色水权市场制度体系研究”，2016—2020年。
2. 国家自然科学基金面上项目：“中国农村集体行动机制与公共事务治理”，2016—2019年。
3. 国家重点研发计划专题子课题：“京津冀水资源协同管理模式研究”，2016—2020年。
4. 清华大学自主科研计划项目：“新一代公共治理：理论、方法与应用”，2015—2017年。
5. 国家自然科学基金面上项目：“基于制度分析与发展（IAD）框架的参与式灌溉管理研究”，2010－2012年。
6. 水利部2010年重大课题：“水利发展阶段研究”，2010－2011年。
7. 国家科技重大专项子课题：“水环境管理责任机制设计与示范研究”，2008－2010年。
8. 国家自然科学基金青年项目：“交易成本约束下的水权市场模拟与管理制度研究”，2006－2008年。
9. 国家社会科学基金项目：“跨行政区水污染防治管理模式研究”，2006－2007年。
10. 水利部委托项目：“转型期中国水资源产权研究”，2002—2003年。